Mijn onderzoek richt zich op impactbeoordelingen van aquatische biodiversiteit met behulp van omgevings-DNA. Ik coördineer ons nationale DNA-barcodeprogramma om een betrouwbare referentiebibliotheek met barcodes van de flora en fauna van Nederland op te zetten. Ik ben betrokken bij diverse nationale en EU-projecten en -opdrachten op het gebied van ecologische impactbeoordelingen in zowel zee- als zoetwater. Ik ben medeoprichter van onze spin-off BioMon Netherlands Center for Genetic Biodiversity Assessment.
Sleutelwoorden
Biodiversiteitsbeoordelingen, menselijke impact, DNA-barcodering, DNA-metabarcodering, omgevings-DNA, macrobenthos, vissen, ecologische kwaliteitsindex, multivariate analyse, Kaderrichtlijn mariene organismen, Kaderrichtlijn water
Onderzoekinteresses
Omgevings-DNA (eDNA) omvat zowel intracellulair als extracellulair DNA en kan in elke omgeving worden verzameld om de lokale soortenpopulaties te bepalen. De ruimtelijke verdeling van deze populaties en hun kenmerken kunnen worden gebruikt om de ecologische status van omgevingen te beoordelen.
De belangrijkste activiteiten zijn:
- Het verzamelen van specimens voor referentiedatabases met DNA-barcodes
- Het verbeteren van op DNA gebaseerde methoden voor effectbeoordelingen
- Het ontwikkelen van op DNA gebaseerde indexen voor het monitoren van de ecologische kwaliteit
- Het onderzoeken van ecologische en biologische soortkenmerken voor ecosysteemanalyse
- Het beoordelen van de impact van menselijke activiteiten op de biologische diversiteit
Actueleonderwerpen
- DNA-barcodering van zoetwater- en zeeorganismen
- GEANS - Genetische ecosysteemgezondheidsbeoordelingen van de Noordzeeregio
- DNA Waterscan - genetische biodiversiteitsmonitoring van de ecologische waterkwaliteit
- DNAqua-Net - genetische instrumenten voor de beoordeling van aquatische biodiversiteit
- eDNA en eMetabolomics; moleculaire beelden van ons onderwaterleven
- DNA-gebaseerde evaluatie van natuurvriendelijke kanaalranden
- Genetische detectie van (sub)tropische muggen in Afrika en het Caribisch gebied
- BioMon Nederlands Centrum voor Genetische Biodiversiteitsbeoordeling
Publicaties
- Weigand, H., Beermann, A. J., Čiampor, F., Costa, F. O., Csabai, Z., Duarte, S., … Van der Hoorn, B. B. … Ekrem, T. (2019). DNA barcode reference libraries for the monitoring of aquatic biota in Europe: Gap-analysis and recommendations for future work. Science of the Total Environment, 678, 499–524. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2019.04.247
- Beentjes, K. K., Speksnijder, A. G. C. L., Schilthuizen, M., Schaub, B. E. M., & van der Hoorn, B. B. (2018). The influence of macroinvertebrate abundance on the assessment of freshwater quality in The Netherlands. Metabarcoding and Metagenomics, 2, 1–8. https://doi.org/10.3897/mbmg.2.26744
- Pawlowski, J., Kelly-Quinn, M., Altermatt, F., Apothéloz-Perret-Gentil, L., Beja, P., Boggero, A., … Van der Hoorn, B. B., … Kahlert, M. (2018). The future of biotic indices in the ecogenomic era: Integrating (e)DNA metabarcoding in biological assessment of aquatic ecosystems. Science of the Total Environment, 637–638, 1295–1310. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.05.002
- Wereld Natuurfonds. 2017. Living Planet Report. Zoute en zilte natuur in Nederland. WNF, Zeist.
